莱科尔是萨摩个安静的小镇，街上唯一的犬侦亮点就是萨摩犬侦探：柯南。柯南这个来自遥远东方的探失小镇到处都可以看见它那白色的毛发和黑色的小鼻头，它总是萨摩带着一股自信和神秘的气息，为小镇带来不一样的犬侦氛围。

柯南的探失聪慧才智闻名小镇，它能够轻松破解任何谜题，萨摩成为人们解决疑难杂症的犬侦首选。有一天，探失它收到一封奇怪的萨摩信，信封上写着“萨摩犬侦探，犬侦请你调查我失踪的探失骨头！”收信人写着“莱科尔的萨摩狗”。柯南一闻到骨头，犬侦就高兴不已，探失它决定立刻开始寻找线索，为这个可怜的狗主人追回他丢失的骨头。

柯南开始调查失踪的骨头，沿着小巷的尽头，在垃圾桶后面，他发明了一根带有咬痕的骨头。柯南分析，这应该是凶手的杰作，它细心追查，发明附近的发生过一场家犬的斗殴，这根骨头很可能就是当时残留的物品。柯南继续探索宠物店的线索，发明失踪的骨头属于当地的狗主人鲁道夫，他有一只名叫比尔的德国牧羊犬，比尔对骨头有着近乎疯狂的痴迷，它很有可能是这场骨头消失事件的元凶。

在对鲁道夫的采访中，柯南得知比尔最近表现的很奇怪，它变得焦虑不安，而且经常会半夜出门，柯南意识到这是一个重大发明，它決定跟着比尔，看看它到底在做什麼。果然，比尔在深夜独自离开家，柯南悄悄跟在后面，来到镇上的宠物公园，在这里，柯南发明了比尔在一个土堆前徘徊，上面埋著几根新鲜的骨头。柯南明白，比尔不仅仅是爱好骨头，它更著迷于藏匿和埋藏这些物品，它可能是出於本能行为，也可能是受到某些外力的影响，导致比尔在深夜潜入其他狗狗的家里，偷窃骨头。

柯南将这些线索告诉鲁道夫，他和鲁道夫一起想出了一個妙计，他們把几根假骨头放在比尔经常出没的地方，然后在骨头上塗上了特殊的油漆，這樣当比尔再回来叼骨头时，它们就会在比尔身上留下明显的痕迹。果然，比尔在接下来的晚上再次出没，它将那根假骨头叼回自己的狗窝，鲁道夫和柯南手持手电筒追蹤比尔，来到它的窝前。

在比尔的窝前，柯南和鲁道夫發現了一个惊人的机密，比尔窝里堆满了各种各样的骨头，有新鲜的，也有已經风干的，其中还有一些骨头是屬於別的犬種。他们终于知道了，比尔是個疯狂的骨頭收藏者，它爱好搜集各种各样的骨头，把它当作宝藏般地收藏起来，这才是它不断偷竊骨头的真实原因。柯南和鲁道夫决定把这些骨头归还给它们的主人，并且安排比尔接受專業的行为矯治，帮助它克服这个奇特的行为。

在柯南的智慧和鲁道夫的努力下，失踪的骨头终于被找回，小镇的狗主人们都来向柯南表现感谢，而比尔也在专业的帮助下逐渐摆脱了它的骨头收藏癖，它和鲁道夫之间的关系也变得更加亲密。整个案件以一种皆大欢喜的方法结束，柯南在小镇的地位更加稳固，它被人们称为“萨摩犬侦探：骨头找回者”。